Desde o começo, o trabalho foi marcado pela união e perseverança da comunidade. Colaboradores como as senhoras Adelaide Von Paraski e Irinéa Nogueira Mendes decoravam o altar improvisado na escola, enquanto integrantes da Ação Católica ensaiavam cantos e ministravam aulas de catecismo. As Santas Missões de fevereiro de 1954, pregadas por Frei Afonso, foram um momento crucial, motivando o retorno de muitos fiéis afastados.

A comunidade realizou diversos eventos para arrecadar fundos e fortalecer a fé, como um festival no Cine Imperial e a exibição do filme “Nossa Senhora de Fátima”. Uma comissão foi criada para organizar a compra do terreno, e o projeto inicial da Matriz, na década de 60, foi considerado bastante ousado para a época.

Em 1955, campanhas de arrecadação de fundos permitiram a compra de um  novo terreno encontrado na Avenida Mirandela, 773, atual endereço da paróquia, e dois lotes de 12,5m x 100m, totalizando 2.500 m², foram cedidos pelo Sr. Aristides Ferreira. Em 1966, a paróquia foi canonicamente erigida. O projeto para substituir a capela, que já não atendia às necessidades, foi elaborado pelo arquiteto alemão Friederich Wilhelm Doepner e as obras foram iniciadas. O jubileu da imagem da padroeira, em 1967, marcou o lançamento definitivo da pedra fundamental da nova igreja. A construção da Igreja Matriz foi interrompida em 1970, restando apenas os acabamentos internos e externos. As obras foram retomadas em dezembro de 1972, sob a direção de Antônio Coelho. A nova Matriz, considerada uma das maiores igrejas da Baixada Fluminense, levou 44 anos para ser concluída, passando por várias fases de construção, modificações e reformas. A igreja foi solenemente dedicada a Deus em 3 de setembro de 2000.

Frei Vitalino Piaia, chegou a Nilópolis no final de 1989 para assumir a paróquia Nossa Senhora Aparecida. Ele coordenou as reformas da casa paroquial, das comunidades e da Matriz. Além de pároco, foi eleito Coordenador da Região IV da Diocese de Nova Iguaçu, Coordenador do Regional dos Frades Baixada/Serra, Coordenador Diocesano de Pastoral e Definidor da Província Franciscana da Imaculada Conceição do Brasil. O frei promoveu um revigoramento nos trabalhos pastorais, como a Gincana Bíblica, para integrar as comunidades. Em 1994, recebeu o título de cidadão honorário de Nilópolis em reconhecimento ao seu trabalho. Em 11 de junho de 2000, um almoço foi realizado para comemorar seu aniversário de 10 anos como pároco, em uma homenagem sincera ao seu empenho e dedicação. Sua pregação na primeira missa de Frei Leodir em 1997 é um trecho de sua mensagem, onde ele destaca a importância de descer da montanha do ideal para a realidade da dor, da fome e da discriminação do povo.